MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p2METDI

Total Repeats: 744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012989	GCG	2	6	19	24	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564254
2	NC_012989	CGATCT	2	12	65	76	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254564254
3	NC_012989	TGG	2	6	85	90	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564254
4	NC_012989	GC	3	6	125	130	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
5	NC_012989	TGC	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
6	NC_012989	CGC	2	6	142	147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564254
7	NC_012989	CGT	2	6	158	163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
8	NC_012989	GGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564254
9	NC_012989	GCG	2	6	190	195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564254
10	NC_012989	GCT	2	6	197	202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
11	NC_012989	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254564254
12	NC_012989	TCG	2	6	235	240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
13	NC_012989	GGC	2	6	260	265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564254
14	NC_012989	TCG	2	6	304	309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
15	NC_012989	TGA	2	6	379	384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254564254
16	NC_012989	CGA	2	6	401	406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564254
17	NC_012989	GC	3	6	413	418	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
18	NC_012989	AC	3	6	462	467	50 %	0 %	0 %	50 %	254564254
19	NC_012989	CACC	2	8	494	501	25 %	0 %	0 %	75 %	254564254
20	NC_012989	GCT	2	6	503	508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
21	NC_012989	CGAT	2	8	574	581	25 %	25 %	25 %	25 %	254564254
22	NC_012989	TC	3	6	623	628	0 %	50 %	0 %	50 %	254564254
23	NC_012989	TCC	2	6	660	665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254564254
24	NC_012989	GCG	2	6	672	677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564254
25	NC_012989	CTG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
26	NC_012989	TCG	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
27	NC_012989	GTC	2	6	792	797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564254
28	NC_012989	TGG	2	6	817	822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564254
29	NC_012989	AGC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564254
30	NC_012989	GGGGC	2	10	885	894	0 %	0 %	80 %	20 %	254564254
31	NC_012989	ATC	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254564254
32	NC_012989	GC	3	6	951	956	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
33	NC_012989	CCT	2	6	961	966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254564254
34	NC_012989	CGC	2	6	974	979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564254
35	NC_012989	CG	4	8	989	996	0 %	0 %	50 %	50 %	254564254
36	NC_012989	GCA	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564254
37	NC_012989	CGAT	2	8	1037	1044	25 %	25 %	25 %	25 %	254564255
38	NC_012989	CTC	3	9	1066	1074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254564255
39	NC_012989	GAG	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564255
40	NC_012989	CGAC	2	8	1150	1157	25 %	0 %	25 %	50 %	254564255
41	NC_012989	GTT	2	6	1310	1315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254564255
42	NC_012989	CCGTGC	2	12	1335	1346	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254564255
43	NC_012989	CG	3	6	1355	1360	0 %	0 %	50 %	50 %	254564255
44	NC_012989	GC	3	6	1375	1380	0 %	0 %	50 %	50 %	254564255
45	NC_012989	GTC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564255
46	NC_012989	CCA	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254564255
47	NC_012989	GCA	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564255
48	NC_012989	ACG	2	6	1512	1517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564255
49	NC_012989	CG	3	6	1530	1535	0 %	0 %	50 %	50 %	254564255
50	NC_012989	CGT	3	9	1639	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564255
51	NC_012989	GGT	2	6	1688	1693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564255
52	NC_012989	GATC	2	8	1762	1769	25 %	25 %	25 %	25 %	254564255
53	NC_012989	GTC	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564255
54	NC_012989	GCA	2	6	1792	1797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564255
55	NC_012989	CGAT	2	8	1809	1816	25 %	25 %	25 %	25 %	254564255
56	NC_012989	CCT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254564255
57	NC_012989	GGC	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564255
58	NC_012989	CGG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564255
59	NC_012989	CGG	2	6	1960	1965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564255
60	NC_012989	GGT	2	6	1982	1987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564255
61	NC_012989	CTGGA	2	10	2060	2069	20 %	20 %	40 %	20 %	254564255
62	NC_012989	CAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254564255
63	NC_012989	GCG	2	6	2110	2115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564255
64	NC_012989	CAG	2	6	3270	3275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564256
65	NC_012989	GGCGC	2	10	3282	3291	0 %	0 %	60 %	40 %	254564256
66	NC_012989	GCACG	2	10	3296	3305	20 %	0 %	40 %	40 %	254564256
67	NC_012989	CCT	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254564256
68	NC_012989	GC	3	6	3402	3407	0 %	0 %	50 %	50 %	254564256
69	NC_012989	ATC	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254564256
70	NC_012989	GCT	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564256
71	NC_012989	GTG	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564256
72	NC_012989	GAG	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564256
73	NC_012989	GGCC	2	8	3548	3555	0 %	0 %	50 %	50 %	254564256
74	NC_012989	GCTC	2	8	3615	3622	0 %	25 %	25 %	50 %	254564256
75	NC_012989	CAC	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254564256
76	NC_012989	CGTAC	2	10	3670	3679	20 %	20 %	20 %	40 %	254564256
77	NC_012989	AGCA	2	8	3805	3812	50 %	0 %	25 %	25 %	254564256
78	NC_012989	CTG	2	6	3839	3844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564256
79	NC_012989	CGA	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564256
80	NC_012989	GAGC	2	8	4053	4060	25 %	0 %	50 %	25 %	254564256
81	NC_012989	CGTG	2	8	4098	4105	0 %	25 %	50 %	25 %	254564256
82	NC_012989	GGA	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564257
83	NC_012989	CGC	2	6	4362	4367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564257
84	NC_012989	CGA	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564257
85	NC_012989	TCG	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564257
86	NC_012989	CTG	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564257
87	NC_012989	GCG	2	6	4426	4431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564257
88	NC_012989	GCC	2	6	4532	4537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564257
89	NC_012989	GGC	2	6	4588	4593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564257
90	NC_012989	CGA	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564257
91	NC_012989	CAC	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254564257
92	NC_012989	GCC	2	6	4735	4740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564257
93	NC_012989	GAT	2	6	4769	4774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254564258
94	NC_012989	CTTG	2	8	4806	4813	0 %	50 %	25 %	25 %	254564258
95	NC_012989	TGC	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564258
96	NC_012989	CTG	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564258
97	NC_012989	GAG	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564258
98	NC_012989	TGCT	2	8	5109	5116	0 %	50 %	25 %	25 %	254564258
99	NC_012989	GC	3	6	5117	5122	0 %	0 %	50 %	50 %	254564258
100	NC_012989	AGGA	2	8	5131	5138	50 %	0 %	50 %	0 %	254564258
101	NC_012989	TCG	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564258
102	NC_012989	AGC	2	6	5172	5177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564258
103	NC_012989	TGG	2	6	5206	5211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564258
104	NC_012989	CCGG	2	8	5221	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	254564258
105	NC_012989	CAG	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564259
106	NC_012989	CGCA	2	8	5705	5712	25 %	0 %	25 %	50 %	254564259
107	NC_012989	CGC	2	6	5745	5750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564259
108	NC_012989	CAG	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564259
109	NC_012989	CCG	2	6	5809	5814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564259
110	NC_012989	ATC	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254564259
111	NC_012989	GAA	2	6	5900	5905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254564259
112	NC_012989	CG	3	6	5922	5927	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
113	NC_012989	CGC	2	6	6027	6032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564259
114	NC_012989	GC	3	6	6053	6058	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
115	NC_012989	GC	3	6	6076	6081	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
116	NC_012989	GCCGA	2	10	6156	6165	20 %	0 %	40 %	40 %	254564259
117	NC_012989	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564259
118	NC_012989	CGA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564259
119	NC_012989	GC	4	8	6257	6264	0 %	0 %	50 %	50 %	254564259
120	NC_012989	GCA	2	6	6331	6336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564259
121	NC_012989	TAG	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254564259
122	NC_012989	GTC	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564259
123	NC_012989	GGTTC	2	10	6428	6437	0 %	40 %	40 %	20 %	254564259
124	NC_012989	ACC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254564259
125	NC_012989	GCTG	2	8	6803	6810	0 %	25 %	50 %	25 %	254564260
126	NC_012989	GAG	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564260
127	NC_012989	GC	3	6	6841	6846	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
128	NC_012989	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
129	NC_012989	TGG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564260
130	NC_012989	CTCC	2	8	6937	6944	0 %	25 %	0 %	75 %	254564260
131	NC_012989	TGC	2	6	6969	6974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564260
132	NC_012989	GAT	2	6	7039	7044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254564260
133	NC_012989	GGC	2	6	7117	7122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564260
134	NC_012989	CG	3	6	7126	7131	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
135	NC_012989	GGC	2	6	7142	7147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564260
136	NC_012989	CG	3	6	7187	7192	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
137	NC_012989	CGC	2	6	7198	7203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564260
138	NC_012989	CG	4	8	7283	7290	0 %	0 %	50 %	50 %	254564260
139	NC_012989	CAGGCG	2	12	7295	7306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	254564260
140	NC_012989	GCCGAT	2	12	7316	7327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	254564261
141	NC_012989	CTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254564261
142	NC_012989	GGCC	2	8	7422	7429	0 %	0 %	50 %	50 %	254564261
143	NC_012989	TGG	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254564261
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145	NC_012989	GCA	3	9	7495	7503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254564261
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149	NC_012989	GAA	2	6	7622	7627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254564261
150	NC_012989	GACCG	2	10	7665	7674	20 %	0 %	40 %	40 %	254564261
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152	NC_012989	GCC	2	6	8039	8044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564262
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241	NC_012989	CG	4	8	12774	12781	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
242	NC_012989	CCGGTG	2	12	12834	12845	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	254564268
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245	NC_012989	AGG	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254564268
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247	NC_012989	GCCG	2	8	13046	13053	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
248	NC_012989	TC	3	6	13112	13117	0 %	50 %	0 %	50 %	254564268
249	NC_012989	CGC	2	6	13122	13127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564268
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251	NC_012989	TCG	2	6	13234	13239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564268
252	NC_012989	GCT	2	6	13283	13288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564268
253	NC_012989	GCG	2	6	13301	13306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564268
254	NC_012989	GCG	2	6	13506	13511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564268
255	NC_012989	GGC	2	6	13517	13522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254564268
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257	NC_012989	TCG	2	6	13534	13539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564268
258	NC_012989	CG	3	6	13561	13566	0 %	0 %	50 %	50 %	254564268
259	NC_012989	CCTG	2	8	13573	13580	0 %	25 %	25 %	50 %	254564268
260	NC_012989	GCT	2	6	13598	13603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254564268
261	NC_012989	ACC	2	6	13636	13641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254564268
262	NC_012989	CGC	2	6	13868	13873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254564268
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264	NC_012989	CTT	2	6	14717	14722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254564269
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392	NC_012989	CG	4	8	20151	20158	0 %	0 %	50 %	50 %	254564274
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